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研究基因組的原理

閱讀:202發布時間:2016-5-19

ELISA試劑盒科學家們在腸道菌群中大規模分析了菌種內部的基因變異。
人類消化道中居住著大量的微生物,它們被統稱為腸道微生物組。腸道微生物組在人類代謝食物、抵御感染和應答藥物等過程中起到了重要的作用。許多人類疾病都與微生物組失衡有關。
我們知道腸道菌群的菌種組成是因人而異的,而一項大規模宏基因組進一步揭示了微生物組驚人的復雜性。
了解菌株水平上的多樣性,對于理解腸道菌組成及其對健康和疾病的影響,是非常關鍵的。
研究團隊將人類微生物組作為一個復雜的系統進行研究,開發了分析微生物組數據的復雜計算方法。這種方法可以在多種腸道菌中分析菌株水平上的遺傳變異。
同種細菌的不同菌株之間,基因或基因拷貝數會出現很大的差異。這種基因拷貝數變異能顯著改變菌株的多種能力,包括耐藥性、毒力、從環境攝取生化分子、分解物質獲得能量、移動方式等等。這些因素決定著菌株的生活方式,能對人類宿主的健康產生影響。
我們可以直接根據法宏基因組數據,在群體中評估菌種中給定基因的拷貝數變異。
通過計算分析定位了每個序列的菌種來源,發現在一百多人的微生物組中,有幾十個菌種的五千多個基因存在著顯著的拷貝數變化。這樣的基因出現在他們所分析的每個菌種中,有些菌種近四分之一的基因都存在拷貝數變異。
這項研究為人們展示了微生物組的廣泛菌株差異,并且鑒定到了一些新菌株。研究顯示,這種基因拷貝數變異與細菌的運動能力、物質運輸和能量獲取有關。菌株水平的多樣性體現了微生物對腸道環境變化的快速適應。
研究人員還發現,一些菌株的基因拷貝數變異與肥胖癥、炎癥性腸病等疾病有關,具有一定的臨床意義。我們希望這項研究能鼓勵人們從一個新的角度研究腸道微生物組,將其視為一個高度適應性的復雜系統,幫助人們通過操縱腸道菌的組成和功能來進行疾病管理。

CAB39L    鈣結合蛋白樣39抗體
CEAM3    癌胚抗原相關細胞粘附分子3抗體
C20orf31    20號染色體開放閱讀框31抗體
CLUAP1    成簇相關蛋白1抗體
CTAG2    腫瘤/睪丸抗原2抗體
CTAG1B    腫瘤/睪丸抗原1B
CTAGE5    皮膚T細胞淋巴瘤相關抗原5抗體(腦膜瘤表達抗原6)
CT3    腫瘤/睪丸抗原3抗體
ARMETL1    腦多巴胺神經營養因子抗體
CADPS2    鈣依賴分泌激活蛋白2/自閉癥的相關蛋白抗體
CCKAR    膽囊收縮素A受體抗體
CBLN3    小腦肽3抗體
CDKL5    周期素依賴性激酶樣5抗體
Alpha chimerin    α1-chimaerin蛋白抗體
CSN7b    信號轉導蛋白9復合體7b抗體
Calcipressin 1/DSCR 1    鈣調神經磷酸酶調節蛋白1抗體(唐氏綜合征候選區域蛋白1樣蛋白1)

ELISA試劑盒


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